ती भाइ प्लेगको कारण मर्दा उनको पुनरुत्थान गर्ने प्रयासमा भाइहरूले प्रतिबन्धित कीमिया प्रविधि अपनाउँछन्। नतिजाको रूपमा, ट्रान्समिटेशन ब्याकफायर र कानूनमा समान विनिमयको साथ, बाँया खुट्टा र अल्फोन्सको एडवर्डको सम्पूर्ण शरीर बर्बाद भयो। एडवर्डले दाहिने पाखुरा गुमाए अल्फोन्सको आत्मा बचाउनको लागि, यसलाई रगतको मोहरमा बाँधेर आर्मरको सूटमा बाँधेर। रोय मुस्ताangले एडवर्डलाई अल्फोन्सको शरीर बहाल गर्ने विधि बन्न आमन्त्रित गर्दछ एक राज्य cheकेमिस्टद्वारा अनुसन्धान गर्न। एडवर्ड विजय, उनको कृत्रिम पोस्ट अंगहरूको अनुसार नाम, पूर्णमेटल Alchemist।
तीन बर्ष पछि, एल्रिक्स पौराणिक दार्शनिकको ढु for्गा खोज्छन् जुन उनीहरूको लक्ष्य प्राप्त गर्न सक्छन्। मार्कोह आफ्ना नोटहरू उनीहरूले फेला पार्न पठाउँछन्, यद्यपि तिनीहरूले ढु factor्गालाई मानव बलिदान भनेर चिनाउन आवश्यक कारक सिक्छन्। मुस्ताangको साथी, मास ह्युजेस, आफ्नो अनुसन्धान गर्दछ, तर Homunculi को रणनीतिका पाउन को लागी एक प्रच्छन्न ईर्ष्या संग गोली मारियो।
इजुमीसँग हेरेर, एल्रिक्सले सिक्छ कि मानव संक्रमणको जन्म उनको गर्भमा रहेको बच्चामा भयो। दुष्ट homunculus लोभ Alphonse कब्जा, तर Amestris अध्यक्ष किंग ब्रैडली द्वारा बचाईएको छ, homunculus Wrath को रूपमा काम देखाईयो। लोभ यस प्रकारले पग्लिन्छ र Homunculi को जन्मदाता पिता भित्र reabsorbed। विन्री र एरिक्स ह्युजेसको साथ जानका लागि मध्य शहर फर्कन्छन् तर उनको बितेको कुरा सिक्छन्। लेफ्टिनेन्ट मारिया रसलाई ह्युजको हत्याको लागि दोषी ठहराइएको छ तर मुस्ताangले हत्या गरेको छ। यद्यपि, एडवर्ड रोसको प्रस्थान चरणमा जान्छन् कि उनी मुस्ताangद्वारा संयुक्त राज्य अमेरिकाबाट जिंग सम्म तस्करी गर्न सकिन्छ जसलाई झिंगी राजकुमार लिंग याओले सहयोग पुर्याइन्। होहेनहेम एड्वर्डको साथ पुनर्मिलन भए तर उनको लामो निवासमा अनुपस्थितिको लागि उनलाई घृणा गर्छन्।
कथा अघि बढ्दै जाँदा, Homunculi नायकहरूले बारम्बार सामना गर्नु पर्छ। मुस्ताangले अभिलाषालाई मार्छ; मुस्ताang र लि्गले घिचुवापन लिन्छन्, यद्यपि उनले ईर्ष्यालाई उनको शून्यमा खान्छ, र एडवर्ड, लिंग-जस्तो पेटमा। ग्लुटनीले अल्फोन्सलाई बुबासित भेट्न लगे तर लिंगचाहिं लोभको एकदमै नयाँ सबैभन्दा नयाँ अवतार हो, जब अरूहरू ग्लुटनीको पेटबाट भाग्छन्। एल्रिक्स आफ्नो पीछा जारी राख्न जारी गरिएको छ यदि पिताले उनीहरूको विरोध गर्नुहुन्न।
ब्रिगसको मुनिको भूमिगत सुरुnel पत्ता लगाउँदै जनरल ओलिभियर आर्मस्ट्र Fatherले फेदर फेला पार्छ र एरिक्सले एक राष्ट्रिय ट्रान्समिटेशन ग्रुप बनाउँदैछ र आफ्ना नागरिकहरूलाई दिन चाहन्छ ताकि ऊ ईश्वरत्वमा जान सक्षम होस्। लोभले बुबा र उनको अघिल्लो सम्झनालाई धोका दिएका छन, जुन पछि मिलेर बनेको छ, र एडवर्ड, किम्ब्ली होहेनहेमको चिमेरा मिनन्स। होहेनहाइमले आफ्ना छोराहरूलाई व्यक्तिगत रूपमा खुलासा गरे कि उनी मरणशील होइनन्, चार सय वर्ष अघि पिताद्वारा जीवित जीवन्त दार्शनिकको ढु right्गामा परिणत भएका थिए।
प्रतिज्ञा दिन आइपुग्छ र बुबाले ग्रहण ग्रहण गर्ने रणनीति सुरू गर्न तयारी गर्नुभयो र मानव बलिदानको लागि आवश्यक बलिदानको रूपमा जसले मानव रूपान्तरण गर्ने प्रयास गरे। सबै मुख्य पात्रहरू बुबाको खनिजसँग संघर्ष गर्दछन्, जुन सबै Homunculi को समयावधि सकियो। बाध्य पाएको मुस्ताang, साथै एल्रिक्स, इजुमी, होहेनहेमलाई संकलन गर्दा कारण बुबाले राष्ट्रिय ट्रान्समिटेशन सक्रिय पार्दछ। जे होस्, स्कार र होहेनहेमले Amestrians लाई काउन्टरमिसेर्स द्वारा सुरक्षित गर्न सक्रिय गर्दछ। बुबाले लोभलाई बर्बाद गर्नुभएको छ, यद्यपि बुबाले माथिबाट सामना गर्नुपर्यो जहाँ नायकहरूले उनको दार्शनिकको ढुone्गा खसाल्न संघर्ष गर्छन्।
अल्फोन्स, जसको हतियारहरू सबै पिताको बिरूद्धको अन्तिम द्वन्द्वमा बर्बाद भएको थियो, दाहिने हात फिर्ता पाउनको लागि आफ्नो आत्मा दिन्छ, जसले फलस्वरूप फादर स्टोनलाई बिगार्यो र उसलाई एडवर्डको सत्यको ईथरको गेटमा फिर्ता पठायो। एडवर्ड आत्मा र अल्फोन्सको शरीर पुन: प्राप्त गर्न किमिया गर्न आफ्नो शक्ति गुमाउँछ। होहेनहेम चिहान देख्छन् जहाँ उनी त्रिश्राको मुस्कुराएको साथ मर्दछन्।
